武汉大学/芝加哥大学联合培养博士后陈黎在Cell Research发表RNA甲基化测序新方法
新闻网讯（通讯员药轩）武汉大学药学院邓子新院士团队和芝加哥大学化学系Chuan He教授团队合作，在Cell Research（一区，IF=44.1）发表了题为“Nm-Mut-seq: abase-resolution quantitative method for mapping transcriptome-wide 2′-O-methylation”的研究论文（2023年6月15日上线）。陈黎博士是该论文的第一作者，芝加哥大学Li-Sheng Zhang博士和Ye Chang博士为共同第一作者；武汉大学药学院赵昌明教授，芝加哥大学化学系Chuan He教授、Bryan C. Dickinson教授为共同通讯作者，邓子新院士参与了此项研究工作。
该项研究开发了针对RNA上2’-O-甲基化(Nm)修饰的测序方法。2’-O甲基化是细胞内含量最丰富的RNA转录后修饰之一，它在调节真核RNA的稳定性和功能中起着关键作用，具有非常重要的生理功能。但是由于缺乏灵敏有效的Nm修饰定位方法，真核生物mRNA中的Nm修饰研究一直受到阻碍。为了突破这一瓶颈，本研究开发了一种基于逆转录酶的新方法，即Nm-Mut-seq，用于定量绘制转录组范围内的2’-O-甲基化修饰。
本研究首先利用蛋白质定向进化的方法，筛选到一个在Nm修饰位点具有诱变性的逆转录酶（RT-41B4），并基于这个特殊的逆转录酶建立一套全转录组范围的Nm甲基化测序方法。该方法可以成功将RNA样品中的Nm修饰，转换成高通量测序结果中的突变信号，方便读取。该方法不仅可以确定低含量RNA（如mRNA）中Nm修饰的位置，还首次实现了转录组Nm甲基化的定量测序。这一新技术为后续研究药物对RNA表观遗传修饰的影响提供了技术支持。
据悉，陈黎博士2018年毕业于武汉大学药学院，2019-2021年受中国博士后基金会的资助赴美国芝加哥大学Chuan He教授课题组开展合作研究。陈黎攻读博士期间主要从事天然产物药物的生物合成研究，目前的研究兴趣集中在天然产物药物对表观遗传组的影响。邓子新院士是微生物药物学和表观遗传学领域的知名学者，在DNA磷硫酰化修饰方面做出了开创性的工作；赵昌明教授是邓子新院士团队的核心成员，主要从事抗衰老药物的生物合成与合成生物学研究。本研究受到美国国立卫生研究院和中国国家重点研发计划合成生物学专项的资助（2018YFA0903200 C.Z.），陈黎博士受中国博士后基金会博后派出项目资助（20190048 L.C.）。
原文链接：https://www.nature.com/articles/s41422-023-00836-w
（实习编辑：赵小凤 编辑：张丽平）
