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【学术前沿动态】诺贝尔化学奖相关论文分析

发布时间:2020-10-14 09:13 来源:图书馆 阅读:
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信息整理:图书馆

2020年诺贝尔化学奖由来自美国加利福尼亚大学伯克利分校的詹妮弗·杜德纳(Jennifer A . Doudna 和德国柏林马克斯·普朗克病原学研究室的埃马纽埃尔·卡彭蒂耶(Emmanuelle Charpentier)两位科学家共同获得,用以表彰她们“开发出一种基因组编辑方法”

两位诺贝尔奖获得者关于基因编辑研究方向的SCIE/SSCI论文有117篇,最早发文年限为2004年,各年度发文分布如图1所示。其中Jennifer A . Doudna以第一作者或者合作者身份发文91篇;Emmanuelle Charpentier以第一作者或者合作者身份发文30篇。117篇论文中,单篇论文被引次数超过1000次的有4篇,单篇最高被引达到5555次,为2012年发表在《Science》的论文“A Programmable Dual-RNA-Guided DNA Endonuclease in Adaptive Bacterial Immunity”。这些论文中,ESI高被引论文有36篇;中国学者参与合作的论文1篇,为中国科学院生物物理研究所于2019年发表在《NATURE COMMUNICATIONS》上。

两位获奖者的学术论文清单详见:https://libguides.lib.whu.edu.cn/c.php?g=665822&p=6765489&preview=95cb73aae815563e61baa2dcf799f9c4

1 两位诺贝尔奖获得者论文年度分布

据检索,截至1010日,两位诺贝尔奖获得者的117篇论文被全球10,962篇论文引用, 其中包括中国学者发表的2143篇论文。表1和图2为全球及中国施引文献的出版年分布。

施引文献涉及114个国家和地区,其中发文量排名前10的国家/地区为:美国(518547.30%)、中国(214319.55%)、德国(9668.81%)、英国(7396.74%)、日本(6255.70%)、法国(4464.07%)、韩国(3893.55%)、加拿大(3783.45%)、荷兰(3443.14%)、澳大利亚(2872.61%)。

施引文献中近五年发表的论文有9,131篇,占全部文献的83.29%。其中全球发文量TOP10的机构见图3

图3 全球发文量TOP10的机构

中国2016-2020年间(部分网络首发文献被排版为2021年,实际为2020年)有1900篇学术论文引用两位诺贝尔奖获得者相关成果,占中国全部施引文献的88.67%,其中发文量TOP10的机构见图4

施引文献中2016-2020年间发表的9131篇涉及Web of Science 类别167个,其中中国作者发表的1900篇涉及Web of Science 类别95个,见表2

近两年来,两位诺贝尔奖获得者的施引文献中有134ESI高被引论文或热点论文,其中中国作者发文35篇,第一完成单位有25篇。134篇高被引论文或热点论文中,2020年有28篇,中国作为第一发文单位的有4篇。发文具体信息如下(其它年份的高被引/热点论文详见:https://libguides.lib.whu.edu.cn/c.php?g=665822&p=6765489&preview=95cb73aae815563e61baa2dcf799f9c4)。


[1] Manghwar H,Li B,Ding X, et al.CRISPR/Cas Systems in Genome Editing: Methodologies and Tools for sgRNA Design, Off-Target Evaluation, and Strategies to Mitigate Off-Target Effects[J].Advanced Science,2020,7(19023126).

中文标题:基因组编辑中的CRISPR/Cas系统:用于sgRNA设计和非靶点评估的方法论和工具、非靶点评估的方法和工具,以及减轻非靶点效应的策略

第一完成单位:华中农业大学

全文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdfdirect/10.1002/advs.201902312


[2] Li H,Yang Y,Hong W, et al.Applications of genome editing technology in the targeted therapy of human diseases: mechanisms, advances and prospects[J].SIGNAL TRANSDUCTION AND TARGETED THERAPY,2020,5(11).

中文标题:基因组编辑技术在人类疾病靶向治疗中的应用:机制、进展与前景

第一完成单位:四川大学

全文链接:https://www.nature.com/articles/s41392-019-0089-y.pdf


[3] Mishra R,Joshi R K,Zhao K.Base editing in crops: current advances, limitations and future implications[J].PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL,2020,18(1):20-31.

中文标题:作物基础编辑:当前进展、局限性和未来影响

第一完成单位:中国农业科学院

全文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdfdirect/10.1111/pbi.13225


[4] Wen L,Liu Q,Xu J, et al.Recent advances in mammalian reproductive biology[J].Science China-Life Sciences,2020,63(1):18-58.

中文标题:哺乳动物生殖生物学研究进展

第一完成单位:北京大学

全文链接:https://link.springer.com/article/10.1007/s11427-019-1572-7


[5] Walton R T,Christie K A,Whittaker M N, et al.Unconstrained genome targeting with near-PAMless engineered CRISPR-Cas9 variants[J].SCIENCE,2020,368(6488SI):290.

中文标题:近PAMless编译的CRISPR-Cas9变异体的无限制基因组靶向研究

全文链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7297043/


[6] Butterfield J S S,Hege K M,Herzog R W, et al.A Molecular Revolution in the Treatment of Hemophilia[J].MOLECULAR THERAPY,2020,28(4):997-1015.

中文标题:用于血友病治疗的分子演化

全文链接:https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1525001619305027


[7] Tomar D,Yadav A S,Kumar D, et al.Non-coding RNAs as potential therapeutic targets in breast cancer[J].Biochimica et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms,2020,1863(1943784).

中文标题:非编码RNA作为乳腺癌治疗的潜在靶点

全文链接:https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1874939919300161


[8] Wessels H,Mendez-Mancilla A,Guo X, et al.Massively parallel Cas13 screens reveal principles for guide RNA design[J].NATURE BIOTECHNOLOGY,2020,38(6):722.

中文标题:大规模平行的Cas13屏幕揭示了引导RNA设计的原理

全文链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7294996/


[9] Guo X,Aviles G,Liu Y, et al.Mitochondrial stress is relayed to the cytosol by an OMA1-DELE1-HRI pathway[J].NATURE,2020,579(7799):427.

中文标题:线粒体应激通过OMA1-DELE1-HRI途径传递到细胞质

全文链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7147832/


[10] Wendisch V F.Metabolic engineering advances and prospects for amino acid production[J].METABOLIC ENGINEERING,2020,58(SI):17-34.

中文标题:代谢工程在氨基酸生产中的研究进展与前景

全文链接:https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1096717619301004


[11] Silverman A D,Karim A S,Jewett M C.Cell-free gene expression: an expanded repertoire of applications[J].NATURE REVIEWS GENETICS,2020,21(3):151-170.

中文标题:无细胞基因表达:一个扩展的全能应用领域

全文链接:https://www.nature.com/articles/s41576-019-0186-3


[12] Stadtmauer E A,Fraietta J A,Davis M M, et al.CRISPR-engineered T cells in patients with refractory cancer[J].SCIENCE,2020,367(eaba73656481):1001.

中文标题:CRISPR工程化T细胞治疗恶性肿瘤

全文链接:https://science.sciencemag.org/content/367/6481/eaba7365


[13] Port F,Strein C,Stricker M, et al.A large-scale resource for tissue-specific CRISPR mutagenesis in Drosophila[J].eLife,2020,9(e53865).

中文标题:果蝇组织特异性CRISPR突变的大规模资源

全文链接:https://elifesciences.org/articles/53865


[14] Al-Shayeb B,Sachdeva R,Chen L, et al.Clades of huge phages from across Earth's ecosystems[J].NATURE,2020,578(7795):425.

中文标题:地球生态系统中的巨大噬菌体分支

全文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2007-4.pdf


[15] Gilpatrick T,Lee I,Graham J E, et al.Targeted nanopore sequencing with Cas9-guided adapter ligation[J].NATURE BIOTECHNOLOGY,2020,38(4):433.

中文标题:Cas9引导的适配连接靶向纳米孔测序、

全文链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7145730/


[16] Miller S M,Wang T,Randolph P B, et al.Continuous evolution of SpCas9 variants compatible with non-G PAMs[J].NATURE BIOTECHNOLOGY,2020,38(4):471.

中文标题:与非G-PAMs相容的SpCas9突变体的连续进化

全文链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7145744/


[17] Schindele A,Dorn A,Puchta H.CRISPR/Cas brings plant biology and breeding into the fast lane[J].CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY,2020,61:7-14.

中文标题:CRISPR/Cas促进植物生物学和育种学快速发展

全文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0958166919300606?via%3Dihub


[18] Makarova K S,Wolf Y I,Iranzo J, et al.Evolutionary classification of CRISPR-Cas systems: a burst of class 2 and derived variants[J].NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY,2020,18(2):67-83.

中文标题:CRISPR-Cas系统的进化分类:一系列2类及其衍生变体

全文链接:https://www.nature.com/articles/s41579-019-0299-x


[19] Andersson R,Sandelin A.Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements[J].NATURE REVIEWS GENETICS,2020,21(2):71-87.

中文标题:增强因子的决定因素和调控元素的促进因子活性

全文链接:https://www.nature.com/articles/s41576-019-0173-8


[20] Kraft V A N,Bezjian C T,Pfeiffer S, et al.GTP Cyclohydrolase 1/Tetrahydrobiopterin Counteract Ferroptosis through Lipid Remodeling[J].ACS Central Science,2020,6(1):41-53.

中文标题:GTP环水解酶1/四氢生物蝶呤通过脂质重建对抗铁下垂

全文链接:https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acscentsci.9b01063


[21] East K W,Newton J C,Morzan U N, et al.Allosteric Motions of the CRISPR-Cas9 HNH Nuclease Probed by NMR and Molecular Dynamics[J].JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY,2020,142(3):1348-1358.

中文标题:基于核磁共振和分子动力学的CRISPR-cas9 HNH核酸酶探针的变构运动研究

全文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.9b10521


[22] Levy J M,Yeh W,Pendse N, et al.Cytosine and adenine base editing of the brain, liver, retina, heart and skeletal muscle of mice via adeno-associated viruses[J].Nature Biomedical Engineering,2020,4(1):97-110.

中文标题:腺相关病毒对小鼠脑、肝、视网膜、心脏和骨骼肌的胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑

全文链接:

http://europepmc.org/backend/ptpmcrender.fcgi?accid=PMC6980783&blobtype=pdf


[23] Pourcel C,Touchon M,Villeriot N, et al.CRISPRCasdb a successor of CRISPRdb containing CRISPR arrays and cas genes from complete genome sequences, and tools to download and query lists of repeats and spacers[J].NUCLEIC ACIDS RESEARCH,2020,48(D1):D535-D544.

中文标题:CRISPRdb的继承者CRISPRCasdb:包含来自完整基因组序列的CRISPR阵列和cas基因以及下载和查询重复序列和间隔区列表的工具

全文链接:https://academic.oup.com/nar/article/48/D1/D535/5590637


[24] Colasante G,Lignani G,Brusco S, et al.dCas9-Based Scn1a Gene Activation Restores Inhibitory Interneuron Excitability and Attenuates Seizures in Dravet Syndrome Mice[J].MOLECULAR THERAPY,2020,28(1):235-253.

中文标题:以dCas9Scn1a基因激活修复Dravet综合征小鼠的抑制性神经元间兴奋并减轻癫痫发作

全文链接:https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1525001619304010


[25] Martinez B,Reaser J K,Dehgan A, et al.Technology innovation: advancing capacities for the early detection of and rapid response to invasive species[J].BIOLOGICAL INVASIONS,2020,22(1SI):75-100.

中文标题:技术创新:提高入侵物种早期发现和快速反应的能力

全文链接:https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/s10530-019-02146-y.pdf


[26] Nguyen D N,Roth T L,Li P J, et al.Polymer-stabilized Cas9 nanoparticles and modified repair templates increase genome editing efficiency[J].NATURE BIOTECHNOLOGY,2020,38(1):44.

中文标题:基于聚合物稳定的Cas9纳米粒子和改良的修复模板提高基因组编辑效率

全文链接:

http://europepmc.org/backend/ptpmcrender.fcgi?accid=PMC6954310&blobtype=pdf


[27] Huang A,Garraway L A,Ashworth A, et al.Synthetic lethality as an engine for cancer drug target discovery[J].NATURE REVIEWS DRUG DISCOVERY,2020,19(1):23-38.

中文链接:合成杀伤力作为癌症药物靶点发现的引擎

全文链接:https://www.nature.com/articles/s41573-019-0046-z


[28] Perera B P U,Faulk C,Svoboda L K, et al.The role of environmental exposures and the epigenome in health and disease[J].ENVIRONMENTAL AND MOLECULAR MUTAGENESIS,2020,61(1SI):176-192.

中文标题:环境暴露和表观基因组在健康和疾病中的作用

全文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdfdirect/10.1002/em.22311


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(编辑:方小利 审核:刘霞)


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